Class ColorEncoder

Method Details

• clearCache

  public void clearCache()

• getSchemeIndex

  private static final int getSchemeIndex(String colorScheme)

• fixName

  private static final String fixName(String name)

• makeColorScheme

  private int makeColorScheme(String name, int[] scale, boolean isOverloaded)

  Parameters:

  name -

  scale - if null, then this is a reset.

  isOverloaded - if TRUE,

  Returns:

  >= 0 for a default color scheme

• getShapely

  private int[] getShapely()

• getAmino

  private int[] getAmino()

• getNucleic

  private int[] getNucleic()

• createColorScheme

  public int createColorScheme(String colorScheme, boolean defaultToRoygb, boolean isOverloaded)

  Parameters:

  colorScheme - name or name= or name=[x......] [x......] .... or name=red,green,blue or filename or https://...

  defaultToRoygb -

  isOverloaded -

  Returns:

  paletteID

• setUserScale

  public void setUserScale(int[] scale)

• getColorSchemeArray

  public int[] getColorSchemeArray(int palette)

• getColorIndexFromPalette

  public short getColorIndexFromPalette(float val, float lo, float hi, int palette, boolean isTranslucent)

• getPaletteColorCount

  private int getPaletteColorCount(int palette)

• getArgbFromPalette

  public int getArgbFromPalette(float val, float lo, float hi, int palette)

• setThisScheme

  private void setThisScheme(String name, int[] scale)

• getArgb

  public int getArgb(float val)

• getArgbMinMax

  public int getArgbMinMax(float val, float min, float max)

• getColorIndex

  public short getColorIndex(float val)

• getColorKey

  public Map<String,Object> getColorKey()

• getColorScheme

  public String getColorScheme()

• setColorScheme

  public void setColorScheme(String colorScheme, boolean isTranslucent)

  Parameters:

  colorScheme -

  isTranslucent -

• setRange

  public void setRange(float lo, float hi, boolean isReversed)

• getCurrentColorSchemeName

  public String getCurrentColorSchemeName()

• getColorSchemeName

  public String getColorSchemeName(int i)

• getColorSchemeList

  public static final String getColorSchemeList(int[] scheme)

• getRasmolScale

  public static final int[] getRasmolScale()

• getPaletteAC

  private int[] getPaletteAC()

• getPaletteWB

  private int[] getPaletteWB()

• getPaletteAtoB

  public static int[] getPaletteAtoB(int color1, int color2, int n)

• getPaletteBW

  private int[] getPaletteBW()

• quantize

  public float quantize(float x, boolean isLowEnd)

  gets the value at the color boundary for this color range fraction

  Parameters:

  x -

  isLowEnd -

  Returns:

  quantized value

• quantize4

  public static final int quantize4(float val, float lo, float hi, int segmentCount)

• colorIndex

  private static final int colorIndex(float q, int segmentCount)

• colorIndexRepeat

  private static final int colorIndexRepeat(float q, int segmentCount)