Package org.jmol.shape

Class Labels

java.lang.Object
org.jmol.shape.Shape
org.jmol.shape.AtomShape
org.jmol.shape.Labels
public class Labels extends AtomShape

  • Field Details

    • strings

      public String[] strings

    • formats

      public String[] formats

    • bgcolixes

      public short[] bgcolixes

    • fids

      public int[] fids

    • offsets

      public int[] offsets

    • atomLabels

      private Map<Integer,Text> atomLabels

    • labelBoxes

      private Map<Integer,float[]> labelBoxes

    • bsFontSet

      public javajs.util.BS bsFontSet

    • bsBgColixSet

      public javajs.util.BS bsBgColixSet

    • defaultOffset

      public int defaultOffset

    • defaultAlignment

      public int defaultAlignment

    • defaultZPos

      public int defaultZPos

    • defaultFontId

      public int defaultFontId

    • defaultColix

      public short defaultColix

    • defaultBgcolix

      public short defaultBgcolix

    • defaultPaletteID

      public byte defaultPaletteID

    • defaultPointer

      public int defaultPointer

    • zeroFontId

      public int zeroFontId

    • setDefaults

      private boolean setDefaults
      defaults are set after giving SELECT NONE;

    • nullToken

      private static final LabelToken[][] nullToken

    • isScaled

      private boolean isScaled

    • scalePixelsPerMicron

      private float scalePixelsPerMicron

    • ptTemp

      private javajs.util.P3 ptTemp

    • pickedAtom

      private int pickedAtom

    • lastPicked

      private int lastPicked

    • pickedOffset

      private int pickedOffset

    • pickedX

      private int pickedX

    • pickedY

      private int pickedY

  • Constructor Details

    • Labels

      public Labels()

  • Method Details

    • initShape

      public void initShape()
      Overrides:
      initShape in class AtomShape

    • setProperty

      public void setProperty(String propertyName, Object value, javajs.util.BS bs)
      Specified by:
      setProperty in class Shape

    • isPickingMode

      private boolean isPickingMode()

    • checkStringLength

      private int checkStringLength(int n)

    • checkBgColixLength

      private int checkBgColixLength(short colix, int n)

    • setPymolLabels

      private void setPymolLabels(Map<Integer,Text> labels, javajs.util.BS bsSelected)

    • setPymolOffset

      private void setPymolOffset(int i, float[] value)
      Sets offset using PyMOL standard array; only operates in cases where label is already defined
      Parameters:
      i -
      value -

    • setScaling

      private void setScaling()

    • setPymolLabel

      private void setPymolLabel(int i, Text t, String format)

    • setLabel

      private void setLabel(LabelToken[][] temp, String strLabel, int i, boolean doAll)

    • addString

      private boolean addString(Atom atom, int i, String label, String strLabel)

    • getProperty

      public Object getProperty(String property, int index)
      Overrides:
      getProperty in class Shape
      Returns:
      true if serviced

    • putLabel

      public void putLabel(int i, Text text)

    • getLabel

      public Text getLabel(int i)

    • putBox

      public void putBox(int i, float[] boxXY)

    • getBox

      public float[] getBox(int i)

    • setLabelColix

      private void setLabelColix(int i, short colix, byte pid)

    • setBgcolix

      private void setBgcolix(int i, short bgcolix)

    • setOffsets

      private void setOffsets(int i, int offset)

    • setHorizAlignment

      private void setHorizAlignment(int i, int hAlign)

    • setPointer

      private void setPointer(int i, int pointer)

    • setZPos

      private void setZPos(int i, int flag, boolean TF)

    • setFont

      private void setFont(int i, int fid)

    • setAtomClickability

      public void setAtomClickability()
      Overrides:
      setAtomClickability in class AtomShape

    • checkObjectClicked

      public Map<String,Object> checkObjectClicked(int x, int y, int modifiers, javajs.util.BS bsVisible, boolean drawPicking)
      Overrides:
      checkObjectClicked in class Shape
      drawPicking - TODO
      Returns:
      Hashtable containing information about pt clicked

    • checkObjectDragged

      public boolean checkObjectDragged(int prevX, int prevY, int x, int y, int dragAction, javajs.util.BS bsVisible)
      Overrides:
      checkObjectDragged in class Shape
      Returns:
      T/F

    • findNearestLabel

      private int findNearestLabel(int x, int y)

    • move2D

      private void move2D(int pickedAtom, int x, int y)

    • getColix2

      public short getColix2(int i, Atom atom, boolean isBg)